Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms