Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms