Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms