Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP47Q96K76 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms