Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COG3Q96JB2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms