Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms