Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms