Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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