Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCN9Q8WX39 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms