Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms