Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE31

FAM13C, Protein FAM13C, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13CQ8NE31 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM13CQ8NE31 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms