Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HJURPQ8NCD3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms