Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAMKVQ8NCB2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAMKVQ8NCB2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAMKVQ8NCB2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAMKVQ8NCB2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAMKVQ8NCB2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAMKVQ8NCB2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAMKVQ8NCB2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAMKVQ8NCB2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CAMKVQ8NCB2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMKVQ8NCB2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms