Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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