Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms