Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP53Q70EK8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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