Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms