Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC12Q6PEW1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms