Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms