Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms