Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBM48Q5RL73 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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