Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms