Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms