Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms