Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms