Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF1Q3BBV0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms