Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CCDC96Q2M329 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CCDC96Q2M329 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC96Q2M329 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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