Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN1Q16658 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms