Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PDK4Q16654 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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PDK4Q16654 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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