Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NPTX1Q15818 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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