Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TRIP10Q15642 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TRIP10Q15642 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TRIP10Q15642 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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