Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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