Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms