Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms