Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IHHQ14623 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IHHQ14623 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IHHQ14623 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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