Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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