Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
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SHROOM2Q13796 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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