Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL2Q13617 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL2Q13617 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms