Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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