Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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