Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DCUN1D2-AS-201ENST00000414992 330 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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MKRN4PQ13434 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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MKRN4PQ13434 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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MKRN4PQ13434 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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MKRN4PQ13434 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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MKRN4PQ13434 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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MKRN4PQ13434 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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