Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms