Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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NME3Q13232 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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NME3Q13232 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NME3Q13232 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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