Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
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