Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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