Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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EFEMP1Q12805 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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