Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAPQ12770 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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