Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms