Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms