Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms